合同漏项，变更问题

河北唐山的工程，已施工完成一半了，但合同是低价中标，且存在大量漏项和变更问题，到现在与甲方仍没有一致意见。合同具体情况如下：1、专用合同条款里“合同价款采用固定单价方式，合同价款调整因素为设计变更、现场签证”；2、专用合同条款里合同价款调整方法为“固定综合单价，以投标书的清单价为准，不进行调整，措施费用一律不予调整”；3、合同通用条款中第59.5条“工程变更导致的合同价款调整按第60条规定对价款进行调整”；4、合同通用条款中第60条规定“合同价价款调整方法按河北省《建设工程工程量清单编制与计价规程》调整价款，具体方法应在专用条款中约定，如专用条款中没有约定，按下列方法调整：（1）变更引起的数量变化10%以内、以外……（2）数量偏差5%以内、以外……（这两条没有争议，关键是下面又加了一条）（3）本合同综合单价不予调整。 请问根据以上合同规定，我们能要求甲方竣工前对缺项漏项及变更签证进行重新组价吗？因为是初学者，我老看这合同规定前后矛盾，规定了调整方法，但又老是提固定单价不予调整，这是什么意思？请各位高手给予指点，谢谢！

问题补充：1、因为专用条款大于通用条款，是不是因为专用条款里约定“固定综合单价，以投标书的清单价为准，不进行调整，措施费用一律不予调整”而且通用条款里在5%、10%调整方法后又约定“本合同综合单价不予调整”，那我通用条款里关于5%、10%以为约定的重新组价就不能成立？ 2、清单是招标时甲方提供的我们投标只负责组价，且当时只有三天时间，所以漏项都没发现，也没提出，现在已经施工我们能否要求对漏项重新组价？如果能是重新签合同还是出补充协议？关于漏项，清单计价规程里有说甲方对清单的准确性完整性负责，但我看清单计价规范不属