单项工程中的清单开列时的专业分类以及报价时的取费问题

如“图1”所示：这是一个新建开发区铺装和绿化总项目中的一个单项工程，主要工作内容为铺装及树池坐凳，在此单项工程中甲方编制者开列的清单项目编码涉及到01土建、02装饰、04市政、05园林四个专业。 疑问1：我在投标时管理费和利润的取费类别是统一用园林取费规则来取呢还是区分专业，不同专业的清单项按照其专用取费规则来取费？如全按照园林费率取费，假定一个施工单位A，此施工单位承包的工程并不止“图1”所示，还有绿化，石桥，园林小品等，单论所承包全部工程的施工复杂程度，已经达到园林二类取费标准，但是本地的园林取费标准是按照单位工程划分的，如按照单位工程划分，“图1”的工程只能算是三类工程了，大家有无遇到此种情况？是按二类还是按三类更合理一点？ 按照最新版的清单规范解释，见“图2”，不同的清单编码合列在一起似乎没有问题，大家平时列清单的时候遇到此种情况怎么处理呢？

问题补充：管理费利润率确实是施工企业自行确定。那咨询单位编制招标控制价时怎么确定费率呢？