清单项目某一部位发生变更，结算是如何调整

接地装置作为一项在投标时按清单项目里工程做法进行了组价，各分项工程量均为投标计算所得，与图纸工程量有偏差，有多余工程项目，施工时设计变更中有一项做法发生了改变，结算时，结算时审计将清单组价内变更项目进行了扣减（此部分工程量套清单时较图纸大），同时把清单内投标时多套的工程量进行了扣减（此部分不涉及变更），审计按变更做法进行了增加，这种做法对吗，本人是这样认为的，变更部分的工程量扣减与增加都应按实际计算，投标时多报的工程量因为不涉及变更不应该做减项，因为这部分多套的项目相当于已经降低了其它清单项目的单价，这种想法对不对，请各位指导，谢谢