关于“其他项目费”中的“机械费调差”疑问

云南2013市政定额中的“其他项目费”里，多出了一项“其他”。这个“其他”中就包含了“人工费调差”、“机械费调差”等。用GBQ4.0(版本5636）做一个工程时（以“机械挖土方”为例），即使调高了汽柴油的价格，机械费仍然不变、该清单的综合单价也就不会发生变化。可实际多出来的机械费跑去哪里了呢？——”其他项目费“里的“机械费调差”。现在我的疑问是：工程结算时，（仍然以“机械挖土方”为例）工程量由招标的3000方变为5000方，如果仍按投标单价结算岂不是要吃亏？（工程里量增加，相应的机械费调差也要增加）；如果要计算新的“机械费调差”就要重新组价，这样岂不是增加工作量？ 如何才能更好的结算呢？针对这个疑问，还望各位高手不吝赐教。