套取参照项可以做适当调整吗？

我做了个预算，是关于管路安装的，管路的材质在定额中没有，我就选了参照项。如衬胶法兰连接管路，因为没有衬胶管路的定额，我就选取了铸钢法兰连接管路套项。因为材料是甲供，我将材料中的主材去掉了，留下了垫片，垫圈之类的。但是我们单位的审计提出材料因为是甲供，所以不能给材料费，需要将材料费全部扣除，这样合理吗？参照项不可以做一些相应的调整吗？

不好意思，我是新手。您要是有时间给我详细解答下。现在主要纠结甲供材，材料费一项是不是应该给。我套用的是参照项，而且是价格较低的，从材料上多要点儿不可以吗？

没有预制，只是安装