总价包干，预算报价中不含的项目如何结算

一个项目招标时包含了多个专业管线，招标范围包括各专业的工程施工及各项窗口服务费、检测费、监理费等。因某种原因，把其中的热力单独拿出不走招投标手续，后续热力工程单独报预算，在于甲方核对过程中，甲方以没有明确收费依据为由，将窗口服务费、检测费、监理费等费用未计入预算价款中，并在预算编制说明中，注明“本次预算不包含.........项目”，单并未明确如发生如何结算。现要对热力项目与甲方签订固定包干价款协议，是否需要在对以上预算价中不含的项目明确说明，如发生按时结算。如不明确，结算时甲方若不同意增加因此发生的费用，预算编制说明的内容是否可作为索赔依据。