竞争性谈判二次报价结算

有一个项目是两个办公室装修，招标的时候分成了单位工程1和单位工程2，项目第一次总报价即投标文件里的价格为298536.08，其中单位工程1投标报价为：99775.01，单位工程2投标报价为：198761.07 ；

第二次报价276000元，其中单位工程1为88000  ，单位工程2为188000（第二次报价只写单位工程1、单位工程2的价格及总价276000，没有清单）；合同也是单位工程1合同金额88000、单位工程2合同金额188000分开签的。

请问结算的时候怎么操作合理。如果是分别按照同比例下浮，单位工程1和单位工程2里面相同工作内容的清单价格变动后就不一致了。