合同价款调整的问题

现在有这么个情况，总承包单位之前2015年承包的一个旧改项目，现在还有一栋因拆迁问题一直拖至现在，其他楼栋都在2年前全部竣工移交，现在甲方即将解决拆迁问题开始做这最后一栋（在已完楼栋中间位置），准备和原施工单位签订补充协议，现由于施工场地受限，降效等等因素需要增加大概500万，现在甲方给了个增补思路，一方面在措施费里面（应该是总价措施，但是根据规定，总价措施费率是不能调整的）增加，如果措施费里面只能增加300万，实在加不了的情况下，另外在综合单价中上浮。各位大神，这个甲方的思路是不是有很大的问题啊？帮捋一下，如果甲方给的思路有问题，那具体正确的方法思路是怎样的？请指导一下，谢谢！