实际结算问题

清单计价结算问题 招标文件上对于工程量签证变更的结算办法： 因分部分项工程量清单漏项或非承包人原因的工程变更，造成增加新的工程量清单项目，其对应的综合单价按下列方法确定： 1、合同中已有适用的综合单价，按合同已有的综合单价确定； 2、合同中有类似的综合单价，按类似的综合单价确定； 3、合同中没有适用或类似的综合单价，由承包人提出综合单价，经发包人确认后执行或按消耗量定额中相应的类别取费（安装《XX省建筑安装工程量消耗量定额》及其配套的有关文件执行，人工费44元/工日，材料价格执行有关规定）。 实际情况：清单计价，清单编制混乱， 有漏项，有多项， 造成签证多。 签证较多，实际结算情况就是大部分按上述第三条后半部分的规定进行，用计价软件记取，另已有综合单价，执行清单综合单价，这个综合单价为分部分项工程量清单中的综合单价， 在软件中直接计入的税前。 这样做是否合理？因分部分项工程量清单中的综合单价里面不含规费、措施费等。一般应该如何处理？求切实可行的办法。