安装预算中的问题

我刚来我们公司，我们是施工方和甲方签订了固定总价合同，合同上没有给风险费也没规定风险范围，只说明了工程变更按照清单项以综合单价不变的方式计算。而且也没有说明具体的施工范围，只是说明了清单中未涉及的工程项目不包括。我来到这以后看了看清单计价书发现很多漏项的内容：给排水、地暖的冲洗、消毒、试压和土方开挖还有地暖的苯板厚度也不对。而且部分给排水主材价格也没有填写。而且我算了算图纸上的很多东西都明显的比清单上的多。还有我们这1到3层给排水基本上都变了，我是计算1到三层的原图纸数量和变更图纸的数量啊还是只计算变更图纸多或少出来的数量啊？如果计算原图三层的和变更后的三层的数量很多阀门都比全部楼的清单上的数量多。而清单上又不能单独抽出这三层的数量。请问各位前辈我该怎么办？