用计价软件做结算存在的疑问

可按合同约定列入分部分项清单里

我现在想在投标报价文件的基础上直接根据实际数量修改原合同数量，然后把签证新增的项目列入到分部分项清单里，套定额计价。但是我有几个疑问：1、这样做的话，原合同数量都已经被我修改了，体现不出合同数量的变化。 只要不是可调合同，原合同的内容都不应该调整；要增加都是在变更、洽商里体现； 2、签证新增的项目是不是都应该列入分部分项清单里？ 新增的项目只要是图纸上或能用实物量计算的项目，尽可能用分部分项清单表示； 比如我们是一座市政桥梁，原合同没有市政管网工程的，在施工过程中为了将市政污水管道引开，埋设了100米污水管道，这笔费用是应该列入分部分项的清单还是列入措施费中呢？ 这是措施项目，也应该用分部分项的清单项目组价。